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学院始建于1978年1985年3月，北京市人民政府京政发38号文通知，建立北京联合大学，下设十二所学院：文理学院、经济管理学院、文法学院、职业技术师范学院、外国语师范学院、旅游学院、自动化工程学院、电子工程学院、机械工程学院、轻工工程学院、纺织工程学院、中医药学院。北京职业大学机电学院设在北京联合大学自动化工程学院，由这两所学院主办，属大学专科性质。1985年5月，化学工程学院、电气化铁道学院、航天工程学院又相继加入北京联合大学。这就是北京联合大学建成初期的十五所分院。1986年9月，北京联合大学轻工工程学院更名为北京联合大学建材轻工学院。1989年12月，北京联合大学电气化铁道学院撤消。1990年8月，北京联合大学经济管理学院并入北京工业大学。1990年6月，航空航天工业部决定，北京联合大学航天工程学院划出北京联合大学。1993年3月，北京联合大学外语师范学院并入首都师范大学。1994年3月，北京联合大学文理学院与文法学院的档案、法律、政治等系合并，撤销北京联合大学文理学院，成立北京联合大学应用文理学院。1994年3月，北京联合大学文法学院改名为北京联合大学继续教育学院。1994年3月18日，北京联合大学自动化工程学院与电子工程学院合并，成立北京联合大学电子自动化工程学院。1996年1月，北京联合大学校部搬迁至北京市朝阳区北四环东路97号。1997年12月，北京联合大学建材轻工学院并入北京联合大学校部，与电子自动化工程学院合并调整，成为信息学院和应用技术学院。1997年12月，北京联合大学纺织工程学院更名为北京联合大学商务学院。2000年1月，市教委同意建立北京联合大学特殊教育学院。2000年2月，市教委同意成立北京联合大学广告学院。2000年12月，市教委决定北京联合大学机械工程学院并入北京联合大学校部。2001年1月，市教委同意原北京化工局职工大学划转给北京联合大学，更名为北京联合大学成人教育部。2002年7月，北京联合大学化学工程学院更名为北京联合大学生物化学工程学院。2003年2月，北京联合大学职业技术师范学院更名为北京联合大学师范学院。2003年11月，北京联合大学成人教育部并入北京联合大学继续教育学院。2004年5月，市教委同意成立北京联合大学平谷学院。2005年3月9日，市教委同意成立北京联合大学国际交流学院。2008年4月，北京联合大学国际语言文化学院、网通软件职业技术学院合并成立北京联合大学应用科技学院。2008年10月，市教委同意北京化工学校和北京市医药器械学校并入北京联合大学。2009年7月，北京联合大学东方信息技术学院撤销。2011年7月，北京联合大学平谷学院撤销。
2016年5月，全国首个机器人学院——北京联合大学机器人学院成立。 [8] 2017年6月，举行北京联合大学智慧城市学院成立大会。 [9] 2018年7月，被教育部评为2018年度全国创新创业典型经验高校；同月，北京联合大学与内蒙古社会主义学院签定联合办学战略合作协议。 [10-11] 2019年7月，北京联合大学与北京交通大学签署战略合作框架协议。

历任校长：
谭元笙：1985.02-1987.10；
李恩元：1987.10-1990.11；
李煌果：1990.12-1994.03；
李光 1994.03-1999.02；
张妙弟：1999,02-2007,04；
柳贡慧：2007.04.20-2012.5；
卢振洋：2012.8-2016.12；
李学伟：2016.12至现今任北京联合大学校长。