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学校肇始于1912年，前身为留美归国、著名医学教育家颜福庆先生创立的长沙红十字会看护训练所，1924年正式建立长沙仁术护病学校。1961年从长沙搬迁至安江建立黔阳地区卫生学校，1984年搬迁至怀化并更名为怀化地区卫生学校。2000年3月，升格为怀化医学高等专科学校。2014年5月，经教育部批准升格并更名为湖南医药学院。

历任院(校)长：
邓维楚：1984.2-1992.10任怀化地区卫生学校校长。黄生信：1993.6-1997.1任怀化地区卫生学校校长；吴以平：1997.1-1997.4任怀化地区卫生学校校长；刘逢吉：1997.4-1998.4任怀化地区卫生学校校长；刘逢吉：1998.4-2000.8任怀化卫生学校校长；刘逢吉：2000.9-2008.12任怀化医学高等专科学校校长；陈涤民：2008.12--2014.12任怀化医学高等专科学校校长；唐圣松：2014.12-2020.1.13任湖南医药学院院长.

截至2020年1月13日，学校官网显示，学校校本部现有在编在岗610人，其中专任教师399人。有教授等正高职称教师53人，有副教授等副高职称教师140人，具有博士学位教师34人、硕士学位教师323人。享受政府特殊津贴专家2人，博士生导师1人，硕士生导师5人，省级教学团队1个，省级学科带头人1人，省级教学名师1人，省级青年骨干教师17人，省级优秀教师1人。

截至2020年1月13日，学校官网显示，学校设有医学院、药学院、护理学院、康复医学与保健学院、检验医学院、口腔医学院、医学人文与管理学院、马克思主义学院、国际教育学院、计算机科学教学研究部、体育教学研究部、继续教育学院。

截至2020年1月13日，学校官网显示，学校占地面积1418亩，校舍建筑面积26.8万㎡，现有教学科研仪器设备总值9342万元，图书馆馆藏纸质图书77万册，中外文纸质期刊578种，电子图书157万册。