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原吉林大学的前身是始建于1946 年的东北行政学院，1948年5月，哈尔滨大学与东北行政学院合并，改称东北科学院；同年东北科学院迁往沈阳，复名为东北行政学院；1950年更名为东北人民大学，1952年经院系调整成为我党亲手创建的第一所综合性大学，1958年更名为吉林大学，1960年，吉林大学被列为全国重点大学，是中国首批建立研究生院的22所大学之一。2000年6月12日由原吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院合并组建成新的吉林大学。2004年8月29日，原中国人民解放军军需大学并入吉林大学。
合并学校历史沿革：
1、吉林工业大学：1954年建立长春汽车拖拉机学院，1958年更名吉林工业大学。
2、白求恩医科大学：1939年建立晋察冀军区白求恩卫生学校和第十八集团军卫生学校；1948年与北方大学医学院合编为华北医科大学；1951年命名为中国人民解放军第一军医大学；1959年更名为吉林医科大学；1978年更名为白求恩医科大学。
3、长春科技大学：1951年建立长春地质专科学校；1952年成立东北地质学院；1958年更名为长春地质学院；1997年更名为长春科技大学。
4、长春邮电学院：1947年创建于黑龙江省佳木斯市；1955年更名为长春电信学校；1960年更名为长春邮电学院。
5、中国人民解放军军需大学：1953年建立中国人民解放军兽医大学。1992年更名为农牧大学。1999年更名为军需大学。
2016年7月，被教育部评为全国创新创业典型经验高校。 [30] 2017年9月，吉林大学入选国家“双一流”（世界一流大学和一流学科）建设高校名单，位列世界一流大学建设高校（A类）； 2018年5月26日，吉林大学人工智能学院成立；吉林大学与中共吉林省委政法委员会签署合作共建协议书；学校同新华三集团、百度在线网络技术（北京）有限公司等5家企业签署合作协议或战略合作备忘录。 2018年7月6日，吉林大学主办21世纪学术联盟第9届总会。1 2019年4月，学校与中国一汽签署战略合作协议。 2019年7月，首批入选中国高校行星科学联盟。 2019年12月18日，吉林大学纪念白求恩逝世80周年暨毛泽东发表《纪念白求恩》80周年大会在长春召开。

历任校长：
伍卓群：1986.1-1995.12任吉林大学校长；刘中树：1995.12-2002.12任吉林大学校长；吴博达：2002.1-22004.7任吉林大学校长；周其凤：2004.7-2008.11任吉林大学校长；展 涛：2008.1-12011.2任吉林大学校长；陈德文代理校长：2011.3-2011.9任吉林大学校长；李元元：2011.9-2018.10任吉林大学校长；张希：2018.12.13到至今任吉林大学党校长。

截至2020年1月10日，学校官网显示，学校师资力量雄厚，有教师6603人，其中教授2233人。中国科学院和中国工程院院士11人，双聘院士53人，哲学社会科学资深教授7人，国务院学位委员会学科评议组成员15人，“万人计划”入选者39人，国家级教学名师7人，中央马克思主义理论研究和建设工程项目首席专家5人，国家“973”计划（含重大科学研究计划）项目首席科学家6人，国家有突出贡献的中青年专家15人，国家“百千万人才工程”入选专家32人，教育部“长江学者奖励计划”入选者68人，国家杰出青年基金获得者37人，国家优秀青年基金获得者37人，吉林省“长白山学者”入选者90人。

截至2020年1月10日，学校官网显示, 学校学科门类齐全，下设50个学院，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等12大学科门类；有本科专业139个，一级学科博士学位授权点48个，交叉学科博士学位授权点2个，一级学科硕士学位授权点61个；博士后科研流动站44个；有一级学科国家重点学科4个（覆盖17个二级学科），二级学科国家重点学科15个，国家重点（培育）学科4个。14个学科（领域）的ESI排名进入全球前1%，其中2个学科排名进入全球前1‰。

截至2020年1月10日，学校官网显示, 学校现有国家重点实验室5个，国家工程实验室1个，国家地方联合工程实验室6个，国家工程技术研究中心1个，教育部人文社会科学重点研究基地6个，教育部重点实验室12个（其中包含2个筹建的教育部重点实验室），教育部工程研究中心5个，教育部省部共建协同创新中心2个，教育部野外科学观测研究站1个，其他行业部委重点实验室21个。学校承担了大量国家级和省部级科研项目，产出了一批产业化前景好、技术含量高的高新技术成果。