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学院始建于1971年3月，经济宁地革委核心领导小组批准，在济宁师范学校和曲阜师范学院附中的基础上建立济宁地区师范专科学校。 1978年，济宁地区师范专科学校更名为济宁师范专科学校，成为全日制普通高等学校。 1998年，济宁教育学院并入济宁师范专科学校。 2000年，济宁师范学校（1970年，济宁县五七师范学校创建；1973年，济宁县五七师范学校先后更名为济宁县师范学校、济宁师范学校） [7] 、济宁艺术学校并入济宁师范专科学校。 2006年3月，曲阜新校区全面启用。 2007年3月，济宁师范专科学校升格为济宁学院。 2008年11月，山东省曲阜师范学校并入济宁学院。 2012年10月，山东省人民政府决定对学校实行“省市共建、医生为主”的管理体制，成为省属高校。

戴洪德：1990.6-1999.6；罗家英:1999.6-2007.3任济宁师范专科学校校长；2007.3-2013.3；吕灵昌：2013.3至现今任济宁学院院长。

截至2020年1月7日，学校官网显示，济宁学院设有20个系（院、部），设置45个本科专业、23个专科专业。

截至2020年1月7日，学校官网显示，共有教职工1249人，专任教师817人，教授67人，副教授250人；具有博士学位的教师81人、具有硕士学位的教师470人；兼职博士研究生导师2人，硕士研究生导师25人；享受国务院特殊津贴者4人，山东省有突出贡献的专家1人，山东省教学名师6人；3个省级教学团队。

截至2020年1月7日，济宁学院有省级特色专业8个、省级精品课程24门、省卓越人才培养计划试点专业2个、省应用型人才培养专业发展支持项目专业2个、省级实验教学示范中心1个、省级教师教育基地1个、省三星级科普教育基地1个、承担省级教学研究与教学改革立项14项。